חיוב למחות את עמלק נובע מכך שהוא סותר את התגלות הקב"ה בארץ, ומפריד בין המוח ללב. עמלק פוגע בעם ישראל על ידי הקרירות, משיכת הכח לתאוות, ואמירה שכל העולם הוא מקרה, ושם צריך להלחם בו. בפורים יש כוח של ברכות בגלל שבו נעשים שותפים כביכול של הקב"ה ביצירת העולם.
עם ישראל שונה מכל העמים בגלל מדרגת קרבת אלוקים שלו, והמלחמה היא על עצם קיומו של עם ישראל.תפקידו של מלך המשיח להשמיד ולהכרית את זרעו של עמלק ולהילחם את כל מלחמות ה'.
לפעמים הטומאה מגיעה גם לתוך הקדש, כמו בספר תורה שכתבו מין: יש אומרים שיש להוציא אזכרות שם ה' מתוכו ולשרוף שאר הספר ויש אומרים שיש לשורפו עם האזכרות שבו. כך בפורים עלינו למחות את עמלק ברמת הקדש.
אם צריך למחות את זכר עמלק, מדוע בכלל מזכירה אותו התורה? אלא שבכל דור ודור ישנה מלחמה עם עמלק, בצורותיו השונות. מול כוח זה מדריכה התורה איך לנצח בעזרת הרוח.
מטרת מצוות זכור את אשר עשה לך עמלק; יש גם עמלקיות בלב שצריך למחותה; "מרדכי לא יכרע ולא ישתחווה" - גבורתו של מרדכי היהודי וגבורתו של מו"ר הרב צבי יהודה; הרבצת התורה של מו"ר.